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Der integrierte Sekundärstruktur-Editor "ERNA-2D"
"ERNA-2D" ist ein äußerst leistungsfähiger Sekundärstruktur-Editor, welcher
erst kürzlich in die ERNA-3D-Software integriert wurde. ERNA-2D kann als
Programm innerhalb des Programms verstanden werden, das mit den 3D-
Funktionen von ERNA-3D auf sehr intelligente Weise kommuniziert.
Mit ERNA-2D ist es nun möglich, Sekundärstruktur-Pläne von Molekülen auf
solch' flexible Art und Weise zu generieren, wie es bisher nie zuvor erreicht
werden konnte.
Analog zu ERNA-3D sind in ERNA-2D Single Strands ebenfalls flexibel und
können auf absolut dynamische Weise "kettentransliert" werden. Doppelheli-
ces und andere Strukturteile können problemlos herumbewegt werden, wobei
alle mit der Struktur verbundenen flexiblen Stränge der Bewegung folgen.
Darüber hinaus ist eine der wichtigsten Eigenschaften von ERNA-2D die Fäh-
igkeit, innerhalb von Sekunden dreidimensionale atomare Strukturen aus der
aktuell editierten Sekundärstruktur heraus zu erzeugen. Außerdem kann ER-
NA-2D mit ERNA-3D kommunizieren, so dass sich in ERNA-2D vorgenommene
Selektionen des Benutzers auf die atomare Struktur in ERNA-3D auswirken.
Eine weitere sehr nützliche Eigenschaft von ERNA-2D ist die Möglichkeit, Se-
kundärstrukturen aus einer in ERNA-3D geladenen atomaren Struktur heraus
zu erzeugen. Auf diese Weise können 3D-Strukturen, die aus einer Datenbank
(z.B. der PDB-Datenbank) extrahiert wurden, in die entsprechende Sekundär-
strukur überführt werden, sofern die Definitionen in der PDB-Datei korrekt sind.
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Die komplette 16S rRNA des E.coli-Ribosomes editiert von ERNA-2D.
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ERNA-2D erlaubt die absolut flexible Manipulation von Sektundärstruktur-
Teilen durch die Verwendung einer sog. "Selbox", die um jeden Bestand-
teil der Sekundärstruktur gezeichnet werden kann.
Die folgenden aufgezeichneten Live-Videos demonstrieren die außer-
gewöhnlichen interaktiven Eigenschaften von ERNA-2D ...
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