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"ERNA-2D" ist ein äußerst leistungsfähiger
Sekundärstruktur-Editor, welcher erst kürzlich in die ERNA-3D-Software
integriert wurde. ERNA-2D kann als Programm innerhalb des Programms
verstanden werden, das mit den 3D- Funktionen von ERNA-3D auf sehr
intelligente Weise kommuniziert. Mit ERNA-2D ist es nun möglich,
Sekundärstruktur-Pläne von Molekülen auf solch' flexible Art und Weise
zu generieren, wie es bisher nie zuvor erreicht werden
konnte. Analog zu ERNA-3D sind in ERNA-2D Single Strands ebenfalls
flexibel und können auf absolut dynamische Weise "kettentransliert"
werden. Doppelheli- ces und andere Strukturteile können problemlos
herumbewegt werden, wobei alle mit der Struktur verbundenen flexiblen
Stränge der Bewegung folgen. Darüber hinaus ist eine der wichtigsten
Eigenschaften von ERNA-2D die Fäh- igkeit, innerhalb von Sekunden
dreidimensionale atomare Strukturen aus der aktuell editierten
Sekundärstruktur heraus zu erzeugen. Außerdem kann ER- NA-2D mit
ERNA-3D kommunizieren, so dass sich in ERNA-2D vorgenommene Selektionen
des Benutzers auf die atomare Struktur in ERNA-3D auswirken. Eine
weitere sehr nützliche Eigenschaft von ERNA-2D ist die Möglichkeit,
Se- kundärstrukturen aus einer in ERNA-3D geladenen atomaren Struktur
heraus zu erzeugen. Auf diese Weise können 3D-Strukturen, die aus einer
Datenbank (z.B. der PDB-Datenbank) extrahiert wurden, in die
entsprechende Sekundär- strukur überführt werden, sofern die
Definitionen in der PDB-Datei korrekt sind. |